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環状遺伝子制御ネットワークの周期振動特性解析

机译:圆形基因控制网络的周期性振动特性分析

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摘要

本稿では,環状遺伝子制御ネットワークにおけるタンパク質濃度の周期振動の周波数·位相·振幅とパラメタの関係を,体系的に理論的に解析する手法を示す.また,解析結果に基づき,一般の環状遺伝子制御ネットワークに対する振動特性とパラメタの関係を明らかにする.具体的には,まず,Iwasakiにより提案されたMultivariable Harmonic Balance法の考え方を応用し,複数の非線形要素が存在する大規模な環状遺伝子制御ネットワークにおける振動解析問題を,固有値·固有ベクトルを求める問題に帰着させる.その後,環状フィードバック構造から生じる固有値の数学的特徴を用いることで,任意個の遺伝子で構成される環状遺伝子制御ネットワークに対して,周期振動特性が解析的に得られることを示す.得られる結果は,パラメタに関して解析的であるため,振動特性を特徴付けるパラメタを抽出し,生物学的考察を行なうことが可能である.本稿では,文献6)で導かれた本質的なパラメタが,タンパク質濃度の振動周波数および位相の変化に大きく影響を与えるパラメタになっていることを明らかにし,数値例題を通して,これらの主張を確認する.
机译:在本文中,我们展示了一种系统地和理论上分析圆形基因控制网络中蛋白质浓度周期性振动的频率,相位和幅度与参数之间的关系的方法。另外,根据分析结果,我们将阐明一般圆形基因控制网络的振动特性和参数之间的关系。具体而言,首先,通过应用Iwasaki提出的多变量谐波平衡方法的思想,将存在多个非线性元素的大规模圆形基因控制网络中的振动分析问题简化为寻找特征值和特征向量的问题。让。之后,利用循环反馈结构产生的特征值的数学特征,表明可以解析地获得由任意基因组成的循环基因控制网络的周期性振动特征。由于获得的结果在参数方面具有分析性,因此可以提取出表征振动特性的参数并进行生物学考虑。在本文中,澄清了参考文献6)中得出的基本参数是对蛋白质浓度的振动频率和相变有很大影响的参数,这些主张已通过数值示例得到了证实。 ..

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