リアルタイム定量PCRと無底ポット栽培を利用したジャガイモそうか病菌の動態解析の試み

摘要

ジャガイモそうか病はStreptomyces spp.により引き起こさ れる病害である.これまで，そうか病菌の定量にはPAI遺伝 子を標的としたリアルタイムPCR法が開発されている.し かし，そうか病菌は菌種により性質が異なり，特に，低pH 耐性はそうか病の防除に直結する.効率的な防除対策のた めには，菌種ごとの定量技術を開発することが必要である. そこで，国内で主要な菌種であるS. scabieiとS. turgidiscabies について，16S-23S rRNA internal transcribed spacerを標的と したリアルタイムPCR法（SYBR Green)による定量技術を 開発した.本定量法はS. scabieiのJKタイプ（Ssj)およびS. turgidiscabies (St)に特異的であり，両菌種とも200fgから 20ngまでのDNA濃度の対数値とCt値との間に高い直線回 帰が認められた（Ssj：が=0.9985, St:R2 = 0.9988).また， 両種が混在した状態の植物ゃ土壤からも，特異的に両菌種 の定量が可能であった.さらに，無底ポット内の黒ポク土壌の異なるpH条件下(植 え付け時のpH 4.4-5.2)で，ジャガイモ栽培を行い，S. turgidiscabies単独接種区，S. scabiei単独接種区，および両菌混合接種区を設けた.収穫時を中心に両菌の菌量およびサクストミン毒素(MAB)量によりそうか病菌量を調査し た結果，S. turgidiscabiesはS. scabieiよりも低レ、pH 4.7以上 で土壤中の菌量が高くなつた.また，両菌を接種した条件 下では，土壌，根および病斑のすべてでS. turgidiscabiesが 優先していた.