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【24h】

SNPsによるイネ品種鑑別法

机译:利用SNPs鉴定水稻品种的方法

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摘要

イネゲノム全塩基配列(プエーズ2レベル)の解読が完了し,シーケンスデータをいかに有効に活用するかが問われる時代となっている。 多様なイネ品種間のSNPs(single nucleotide polymorphisms,一塩基多型)の探索はポストゲノムシーケンス時代の最重要課題の一つであり,有用遺伝子の同定や機能解明,DNAマーかー育種の高速化への貢献が期待されている。 このような背景のもと,植物ゲノムセンター(Plant Genome Center,PGC)では平成13年からイネSNPの網羅的探索を行っている。 その中で,わずかに得られる日本稲近縁品種間のSNPを利用することにより,現在日本で栽培されている主要な品種の米を相互識別する系を確立した。 本稿では,研究を開始した背景と進展状況,および開発した品種鑑別システムと現在提供しているDNA鑑定サービスについて解説する。
机译:现在,水稻基因组的整个碱基序列(Puaze 2级)已被解码,问题是如何有效利用序列数据。在后基因组序列时代,在各种水稻品种中寻找SNP(单核苷酸多态性)是最重要的问题之一,以鉴定有用的基因,阐明其功能,并加速DNA育种。有望做出贡献。在此背景下,植物基因组中心(PGC)自2001年以来一直在进行水稻SNP的全面搜索。其中,我们建立了一个系统,通过使用与日本大米密切相关的品种中略有获得的SNP,相互区分目前在日本栽培的大米。在本文中,我们将解释研究的背景和进展,已开发的品种鉴定系统以及目前提供的DNA鉴定服务。

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