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クラウド型計算機資源利用に基づいた新型DNAシークェンサ大量配列解析

机译:基于云型计算机资源利用的新型DNA测序仪质量序列分析

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摘要

ゲノム研究分野では,塩基配列を決定するDNAシー クェンシング装置の解読速度が近年加速的に進歩した結 果,ゲノム解析数や疾患遺伝子同定数が飛躍的に伸びて いる.新型または次世代シークェンサと呼ばれるこの高 速シークェンシング装置の普及に伴い,大量の塩基配列が低コス卜で短期間に得られるようになった.しかし同 時に,大規模配列データは保管用ストレージに解析用計 算機不足,さらには解析するための研究者や技術者が足 りないという問題をひき起こしている.このような新型シークェンサ大量配列解析に付随する 保管、解析の計算機資源不足問題への対処策を講じるた めに,日本DNAデータバンク(DNA Data Bank of Japan : DDBJ)ではクラウド型計算機資源利用に基づい た新型シークェンサ大量配列のデータ保管と定型解析処 理を提案している.クラウド型の計算機資源利用とは, 手元の計算機の性能が高くなくてもィンタ一ネット経由 で保管資源や解析処理資源を入手する遠隔地の計算機資 源利用法を表わす.
机译:在基因组研究领域中,用于确定碱基序列的DNA测序仪的解码速度近年来有所提高,因此,基因组分析和疾病基因鉴定的数量急剧增加,被称为新一代或下一代测序仪。随着该高速测序装置的广泛使用,可以在短时间内以低成本获得大量碱基序列,但是,同时缺乏用于存储的大型序列数据和用于分析的计算机。 ,此外,这引起了一个问题,即没有足够的研究人员和工程师进行分析,应采取措施解决这种新型定序器质量序列分析所伴随的用于存储和分析的计算机资源不足的问题。为此,日本DNA数据库(DDBJ)提出了基于云型计算机资源利用的大量新测序仪的数据存储和例行分析处理方法。指示即使手边的计算机性能不高,如何使用偏远地区的计算机资源来通过Internet获取存储资源和分析处理资源。

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