Изучена возможность использования конъюгатов олигонуклеотидов с лигандами малой бороздки в качестве зондов в гибридизационных микрочипах. Конъюгаты олигонуклеотидов содержали шпилечный лиганд (MGB), состоящий из двух трипирролкарбоксамидных остатков, соединенных остатком аминомасляной кислоты и связывающийся сайт-специфичным образом с А-Т-трактом олиго-нуклеотидного дуплекса. Зондами являлись (5'-31): GACAAGAp, GACAAAAp, GACAAGA-MGB, GACAAAA-MGB, а олигонуклеотиды, меченные флуоресцентным цианиновым красителем СуЗ -СуЗ-ACTAATTTTGTC и СуЗ-ACTAATCTTGTC, использовались как мишени. Показано, что для дуплекса, содержащего в сайте связывания с лигандом только А-Т-пары, влияние MGB на уровень флуоресценции слотов микрочипа является максимальным и приводит к его четырехкратному увеличению по сравнению с исходным немодифицированным дуплексом. Наличие в сайте связывания А-С- и G-T-мутаций (несовершенные дуплексы) или G-C-пары (совершенный дуплекс) сказывается на изменении уровня флуоресценции в существенно меньшей степени.
展开▼
