МЕХАНИЗМ УЗНАВАНИЯ СУПЕРСКРУЧЕННОЙ ДНК ЭУКАРИОТИЧЕСКИМИ ТОПОИЗОМЕРАЗАМИ ПЕРВОГО ТИПА II. СРАВНЕНИЕ ВЗАИМОДЕЙСТВИЯ ФЕРМЕНТОВ СО СПЕЦИФ

摘要

Обобщены результаты исследования взаимодействия ДНК-топоизомераз первого типа из клеток мыши и плаценты человека со специфическими олигонуклеотидами различной структуры и длины. Проведена оценка относительного вклада различных контактов между ферментом и ДНК, обнаруженных с помощью рештеноструктурного анализа (РСА) и описанных ранее в литературе, в общее сродство фермента к субстрату, Выявлены факторы, определяющие различие во взаимодействии ферментов со специфическими и неспецифическими одно- и двухцепочечными ДНК. Результаты РСА комплекса ДНК с топоизомеразой I интерпретированы с учетом данных по детальному термодинамическому и кинетическому анализу взаимодействия фермента со специфическими и неспецифическими ДНК.