机译:ISFOLD:非螺旋RNA基序中碱基对的结构预测,基于等位性标记的序列比对。
Base Pairing; Base Sequence; Computer Simulation; Molecular Sequence Data; 碱基对; 碱基序列; 计算机模拟; 分子序列数据; 核酸构象; 序列排列; 序列分析; RNA;
机译:ISFOLD:非螺旋RNA基序中碱基对的结构预测,基于等位性标记的序列比对。
机译:RNA母题中的等排和非等排碱基对:Sarcin-Ricin内环的分子动力学和生物信息学研究
机译:使用RNA序列的MRNA结合的蛋白质特异性预测,结合基序和预测的二次结构
机译:成对蛋白质序列基序和配体亚结构的蛋白质 - 配体相互作用的预测
机译:RNA中串联错配和Watson-Crick碱基对的稳定性和结构的序列依赖性。
机译:在基于知识的统计潜力中使用序列签名和转折基序进行RNA结构预测
机译:图4:(a)一种保守序列,其发生在芯片-SEQ数据集中的46,264个结合位点峰值中的79倍。说明了这种保守序列的突变分布,其中'_'表示该碱度不变; del表示此基础丢失; INS X表示新的基础X插入此基础前面。 (b)列出了几种重复的元素模式。 (c)在第一栏中,示出了由MEME芯片工具(Machanick&Bailey,2011)开采的前五个DNA主题。由CFSP算法发现的相应保守序列列于第二列中。在第三列中,列出了从突变信息转换的特定位置的评分矩阵。 MEME主题与PSSM格式的相似性与PSSM格式之间的相似性通过邮票图章比较工具(Mahony&Benos,2007)计算。这些对相似性的电子值显示在第四列中。 (d)在由GKMSVM描述符聚集的每个组中选择了一个图案,下面列出了CFSP算法的相应主题。 (e)从https://www.encodeproject.org收集的,有附加数据集(文件no:cernff100grl,cenf616irl,conf8.20cer,target:srebf1)。使用MEME工具在每个文件中选择前两个图案,并且我们的算法发现的相应主题如下所示。
机译:CpG寡脱氧核苷酸的关键DNa侧翼序列,但不是6碱基CpG基序,可被RNa取代,而Toll样受体9介导的活性无定量或定性变化