遺伝子解析による生態系解析技術の進展と課題

摘要

従来，環境中の複合微生物の微生物相は，それぞれがもつ16S rRNA遺伝子，18S rRNA遺伝子， 機能遺伝子などをPCR法により増幅し，クローン ライブラリ一法やDGGE法により解析がなされて きた。これらの手法は，微生物生態系を構成する 主要な微生物を解析するうえでは有用であるが， 少ない比率で存在する微生物の検出は困難であ る。近年，環境中の微生物相や微生物の機能を解 析する研究において次世代シーケンサーが適用さ れるようになった。筆者が所属する東京農業大学 においても生物資源ゲノム解析センターが組織と して新設され，共同利用•共同研究拠点「生物資 源ゲノム解析拠点」として文部科学省より認定を 受け，次世代シーケンサーを用いた研究が推進さ れている。