フラグメントスクリーニング

摘要

HTSではヒット•リード化合物を得ることができない， または既存の化合物ライブラリーには含まれていない母骨 格構造を有するヒット化合物を得る目的で主に実施される スクリーニングである。フラグメントライブラリーに含ま れている化合物は，Rule of Three (分子量< 300 Da, clogP< 3，水素結合ドナー数<3,水素結合ァクセプター数<3な ど）と呼ばれる化合物の物性条件を満たしたもので構成さ れていることが多い。フラグメント化合物は比較的シンプ ルな化学構造をしているため，タンパク質に対する結合親和性は低い。したがってフラグメントライブラリーを用い たァッセィ系では化合物が比較的高濃度条件となっており， 高感度な評価系も必要とされる。フラグメントライブラ リーは，比較的水溶性の高い化合物を揃えていることに なっているものの，このように高濃度条件を必要とするた め，不溶化も起こしやすい。主に数千化合物で探索する。 ヒット化合物の同定までには数ケ月から半年ほどの期間を 要し，サブmMレベルのヒット化合物が得られる。