ヌクレオソームのポジショニング状況とクロマチンへの到達性scMNase-seq法で明らかに

摘要

ミクロコッカスヌクレアーゼを使った単一細胞塩基配列解読によって明らかになったヌクレオソーム構成の原則について、米国立衛生研究所のB·Lai氏らが報告している。ヌクレオソームポジショニングは、クロマチンへの到達のしゃすさに極めて重要であり、細胞の遺伝子発現プログラムに関連付けられている。ヌクレオソームをマッピングするこれまでの手法では、細胞集団から得られたプロファイルを統台するので、細胞での平均的なパターンが明らかになる。すなわち、ヌクレオソームは活性な遺伝子の転写開始部位とDNァーゼー高感受性部位を取り囲むように配置され、位相配列を形成している。しかし、均一な細胞集団であっても、細胞の遺伝子発現には活発なシグナル伝達に応じた不均一性が見られ、これはクロマチンへの到達可能性の不均一性と関係しているかもしれない。