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タンパク質全電子計算におけるモデル化学に関する研究

机译:蛋白质全电子计算中的模型化学研究

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摘要

All-electron calculations of protein using various exchange-correlations functional and basis sets were carried out. Based on these results, we have evaluated the dependencies of fundamental physical properties on theoretical model and basis set. In the quantum calculations of large molecule such as proteins, the easy way of precise theoretical method and large basis set makes explosive high computational costs. In this report, we present a model chemistry which gives good chemical properties and economical computational costs for all-electron calculation for proteins.%タンパク質全電子密度汎関数計算を様々な交換相関汎関数や基底関数を用いて行い,基本的な物理量における計算方法依存性,基底関数依存性を評価した.タンパク質のよう。な巨大分子の量子化学計算では,高精度な計算方法・大きな基底関数の安易な選択は,爆発的な計算コストの増大をもたらす.本研究において,シミュレーションに要求される精度を保ちつつ,計算コストを抑える,タンパク質全電子計算に適したモデル化学の指標を示すことができた.
机译:使用各种交换相关函数和基集对蛋白质进行全电子计算,基于这些结果,我们评估了基本物理性质对理论模型和基集的依赖性。在蛋白质等大分子的量子计算中,精确的理论方法的简便方法和较大的基础集使得爆炸性的高计算成本。在本报告中,我们提出了一种模型化学,该化学为蛋白质的全电子计算提供了良好的化学性质和经济的计算成本。我们使用各种交换相关函数和基函数进行了函数计算,并评估了基本物理量的计算方法依赖性和基函数依赖性。像蛋白质。在大分子的量子化学计算中,高精度的计算方法和易于选择的大基函数导致计算成本的爆炸性增长。在这项研究中,我们能够显示适合蛋白质全电子计算的模型化学指标,从而保持了仿真所需的准确性并降低了计算成本。

著录项

  • 来源
    《生産研究》 |2010年第3期|p.39-46|共8页
  • 作者单位

    東京大学大学院工学系研究科;

    東京大学生産技術研究所 機械・生体系部門;

    東京大学生産技術研究所 機械・生体系部門;

  • 收录信息
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 jpn
  • 中图分类
  • 关键词

  • 入库时间 2022-08-18 03:50:09

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