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Integrated genomic characterization of endometrial carcinoma

机译:子宫内膜癌的综合基因组学表征

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摘要

We performed an integrated genomic, transcriptomic and proteomic characterization of 373 endometrial carcinomas using array- and sequencing-based technologies. Uterine serous tumours and ~25 % of high-grade endometrioid tumours had extensive copy number alterations, few DNA methylation changes, low oestrogen receptor/progesterone receptor levels, and frequent TP53 mutations .Most endometrioid tumours had few copy number alterations or TP53 mutations, but frequent mutations in PTEN, CTNNB1, PIK3CA, ARID1A and KRAS and novel mutations in the SWI/SNF chromatin remodelling complex gene ARID5B. A subset of endometrioid tumours that we identified had a markedly increased transversion mutation frequency and newly identified hotspot mutations in POLE. Our results classified endometrial cancers into four categories: POLE ultramutated, microsatellite instability hypermutated, copy-number low, and copy-number high. Uterine serous carcinomas share genomic features with ovarian serous and basal-like breast carcinomas. We demonstrated that the genomic features of endometrial carcinomas permit a reclassification that may affect post-surgical adjuvant treatment for women with aggressive tumours.%来自“癌症基因组图谱研究网络”的这篇论文rn发表了对350多名患者的子宫内膜肿瘤所做rn的一项全基因组深度分析。基于一系列基因rn组特征(包括在DNA聚合酶基因POLE上新发rn现的热点突变和ARID5B DNA.结合蛋白中的rn新颖突变),本文作者提出将子宫内膜肿瘤重rn新划分成四个不同类型。这对患有恶性肿瘤rn的妇女的术后辅助治疗也许会有临床意义。
机译:我们使用基于阵列和测序的技术对373例子宫内膜癌进行了基因组,转录组和蛋白质组学的综合表征。子宫浆液性肿瘤和约25%的高度子宫内膜样肿瘤具有广泛的拷贝数变化,DNA甲基化变化少,雌激素/孕激素受体水平低和频繁的TP53突变。大多数子宫内膜样肿瘤具有很少的拷贝数变化或TP53突变,但是PTEN,CTNNB1,PIK3CA,ARID1A和KRAS中的频繁突变以及SWI / SNF染色质重塑复杂基因ARID5B中的新突变。我们确定的子宫内膜样肿瘤的一个子集具有明显增加的颠换突变频率和新发现的POLE热点突变。我们的结果将子宫内膜癌分为四类:POLE超突变,微卫星不稳定性超突变,拷贝数低和拷贝数高。子宫浆液性癌与卵巢浆液性和基底样乳腺癌共享基因组特征。我们证明子宫内膜癌的基因组特征允许重新分类,这可能会影响具有侵袭性肿瘤的妇女的手术后辅助治疗。%来自“癌症基因组图谱研究网络”的这一论文发表了对350多名患者的子宫内膜基因工​​程rn的一个全基因组深度分析。基于各种基因rn组特征(包括在DNA聚合酶基因POLE上新发rn现的事件突变和ARID5B DNA。结合蛋白中的rn新颖突变),本文作者提出将子宫内膜肿瘤重rn新划分成四个不同类型。这对患有恶性肿瘤的妇女的植入辅助治疗也许会有临床意义。

著录项

  • 来源
    《Nature》 |2013年第7447期|67-73A3|共8页
  • 作者单位

    The Eli and Edythe L. Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University Cambridge, Massachusetts 02142, USA;

    The Eli and Edythe L. Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University Cambridge, Massachusetts 02142, USA;

    The Eli and Edythe L. Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University Cambridge, Massachusetts 02142, USA;

    The Eli and Edythe L. Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University Cambridge, Massachusetts 02142, USA;

    The Eli and Edythe L. Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology and Harvard University Cambridge, Massachusetts 02142, USA;

  • 收录信息 美国《科学引文索引》(SCI);美国《工程索引》(EI);美国《生物学医学文摘》(MEDLINE);美国《化学文摘》(CA);
  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 eng
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