RUMEN METAGENOME SEQUENCING TECHNOLOGY

摘要

La cría de los rumiantes y los productos derivados de ellos tienen una alta importancia económica en el mundo. El rumen forma parte del complejo sistema digestivo de los rumiantes y contiene una comunidad microbiana de suma importancia para hospedero ya que sus funciones están relacionadas con la salud, productividad y emisión de gases con efecto invernadero, entre otros. Dentro de la comunidad microbiana del rumen, la población bacteriana constituye la biomasa poblacional más alta, son los más activos en la fermentación de los alimentos y son considerados una fuente importante de nutrientes para el rumiante. Las tecnologías de secuenciación del ADN en la era molecular, ha permitido identificar un número sin precedentes de microorganismos a través de la metagenómica, identificando comunidades microbianas a partir de la secuencia de marcadores moleculares, integrados en todos los microorganismos. Los estudios metagenómicos incrementaron de forma efectiva el conocimiento relacionado con la diversidad microbiana ruminal. Sin embargo, son numerosos los factores que pueden influir sobre la inferencia de los perfiles poblacionales, lo que vuelve complicado la comparativa entre estudios. Esta revisión analiza diversos factores que pueden generar variabilidad en los perfiles de la población microbiana y presenta el estado del arte de las tecnologías de secuenciación aplicadas en estudios metagenómicos. Por otro lado, realiza una comparativa entre diversos estudios y meta-análisis del microbioma del rumen, con un enfoque en las poblaciones dominantes y sus funciones. Finalmente, realiza una propuesta que podría ser útil en el difícil reto de manipular de forma efectiva la composición y función del microbioma ruminal y abrir la posibilidad para una producción sustentable.