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Comparación de tres métodos de extracción de ADN a partir de garrapatas duras (Acari: Ixodidae)

机译:从硬壁hard提取DNA的三种方法的比较(Acari::科)

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摘要

RESUMEN Las garrapatas son el grupo de ectoparásitos de mayor relevancia en la transmisión de patógenos a los animales domésticos y a humanos. La detección de estos agentes, normalmente, se realiza por métodos basados en PCR y, por ello, se requiere de la obtención de ácidos nucleicos, para la amplificación selectiva de dianas moleculares. El objetivo de la presente investigación fue comparar el desempe?o de tres métodos de extracción de ADN, sales, columnas y tiocianato de guanidina, a partir de garrapatas, para estudios de detección de patógenos y sistemática molecular de garrapatas. Se realizaron comparaciones múltiples del desempe?o de extracción sobre 30 muestras de garrapatas y se valoró la calidad del extracto de ADN, mediante la amplificación de un fragmento del gen mitocondrial 16S de garrapatas, con la utilización de la técnica de PCR. Además, se evaluó la presencia de patógenos de los géneros Rickettsia, Ehrlichia, Anaplasma y Babesia. El método con mayor desempe?o en la extracción de ADN fue el basado en tiocianato de guanidina (mdnR=160ng/uL), seguido por columnas (mdnR=4,7ng/uL) y luego sales (mdnR=1,6ng/uL). Se presentaron diferencias estadísticas en el rendimiento de la extracción; no obstante, no existieron diferencias respecto al éxito de amplificación, mediante PCR, de acuerdo con el método de extracción (p=0,1173). No se detectaron patógenos rickettsiales o piroplasmas en ninguno de los extractos de ADN de garrapatas evaluados. Considerando el costo/beneficio de los métodos comparados, la utilización del método de sales puede facilitar la masificación de trabajos sobre la detección de patógenos que son transmitidos por garrapatas, en laboratorios de discreto presupuesto.
机译:摘要cks虫是病原体向家畜和人类传播的最重要的外寄生虫类。这些试剂的检测通常通过基于PCR的方法进行,因此,选择性扩增分子靶标需要获得核酸。本研究的目的是比较tick的DNA提取,盐,柱和硫氰酸胍三种方法的性能,以研究for的病原体检测和分子系统。在30个滴答样品上进行了多次提取性能比较,并使用PCR技术通过扩增来自滴答的线粒体16S基因的片段来评估DNA提取物的质量。此外,评估了立克次体,埃里希氏体,无浆膜和巴贝斯氏菌属的病原体的存在。在DNA提取中性能最高的方法是一种基于硫氰酸胍(mdnR = 160ng / uL)的方法,其次是色谱柱(mdnR = 4.7ng / uL),然后是盐(mdnR = 1.6ng / uL)。 )。提取性能有统计学差异;但是,根据提取方法,通过PCR扩增的成功率没有差异(p = 0.1173)。在任何评估的壁虱DNA提取物中均未检测到立克次氏体或原虫病原体。考虑到比较方法的成本/收益,盐法的使用​​可以在预算分散的实验室中促进大量检测tick虫传播的病原体的工作。

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