High diversity of fungi recovered from the roots of mature tanoak (Lithocarpus densiflorus) in northern California

摘要

We collected mature tanoak (Lithocarpus densiflorus (Hook. & Arn.) Rehder) roots from five stands to characterize the relative abundance and taxonomic richness of root-associated fungi. Fungi were identified using polymerase chain reaction (PCR), cloning, and sequencing of internal transcribed spacer (ITS) and 28S rDNA. A total of 382 cloned PCR inserts were successfully sequenced and then classified into 119 taxa. Of these taxa, 82 were basidiomycetes, 33 were ascomycetes, and 4 were zygomycetes. Thirty-one of the ascomycete sequences were identified as Cenococcum geophilum Fr. with overall richness of 22 ITS types. Other ascomycetes that form mycorrhizal associations were identified including Wilcoxina and Tuber as well as endophytes such as Lachnum, Cadophora, Phialophora, and Phialocephela. The most abundant mycorrhizal groups were Russulaceae (Lactarius, Macowanites, Russula) and species in the Thelephorales (Bankera, Boletopsis, Hydnellum, Tomentella). Our study demonstrates that tanoak supports a high diversity of ectomycorrhizal fungi with comparable species richness to that observed in Quercus root communities.Les auteurs ont prélevé des racines de Lithocarpus densiflorus (Hook. & Arn.) Rehder) dans cinq peuplements, afin de caractériser l'abondance relative et la richesse taxonomique des champignons associés à ses racines. On a identifié les champignons à l'aide du PCR, par clonage et séquençage de l'ITS et du 28S rADN. On a séquencé avec succès 382 segments clonés par PCR avant de les classifier en 119 taxons. De ces taxons 82 appartiennent aux basidiomycètes, 33 aux ascomycètes et 4 aux zygomycètes. On a identifié 31 des séquences ascomycètes au Cenococcum geophilum Fr. avec une richesse d'ensemble constituée de 22 types ITS. On a identifié d'autres ascomycètes qui forment des associations mycorhiziennes, incluant les genres Wilcoxina et Tuber ainsi que des endophytes, soient des Lachnum, Cadophora, Phialophora et Phialocephala. Les groupes mycorhiziens les plus abondants sont les Russulaceae (Lactarius, Macowanites, Russula) et des espèces de Théléphorales (Bankera, Boletopsis, Hydnellum, Tomentella) Cette étude démontre que le Lithocarpus densiflorus supporte une grande diversité de champignons ectomycorhiziens et une richesse en espèces comparable à celles observées chez les racines de communautés de Quercus.