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Maturation and diversity of the VRC01-antibody lineage over 15 years of chronic HIV-1 infection

机译:慢性HIV-1感染15年以来VRC01抗体谱系的成熟度和多样性

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摘要

HIV-1-neutralizing antibodies develop in most HIV-1-infected individuals, although highly effective antibodies are generally observed only after years of chronic infection. Here we characterize the rate of maturation and extent of diversity for the lineage that produced the broadly neutralizing antibody VRC01 through longitudinal sampling of peripheral B cell transcripts over 15 years and co-crystal structures of lineage members. Next-generation sequencing identified VRC01-lineage transcripts, which encompassed diverse antibodies organized into distinct phylogenetic clades. Prevalent clades maintained characteristic features of antigen recognition, though each evolved binding loops and disulfides that formed distinct recognition surfaces. Over the course of the study period, VRC01-lineage clades showed continuous evolution, with rates of ~2 substitutions per 100 nucleotides per year, comparable to that of HIV-1 evolution. This high rate of antibody evolution provides a mechanism by which antibody lineages can achieve extraordinary diversity and, over years of chronic infection, develop effective HIV-1 neutralization.
机译:尽管通常仅在多年慢性感染后才能观察到高效抗体,但在大多数被HIV-1感染的个体中都会产生HIV-1中和抗体。在这里,我们描述了通过15年以上外周B细胞转录本的纵向采样以及谱系成员的共晶体结构产生广泛中和抗体VRC01的谱系的成熟率和多样性程度。下一代测序鉴定了VRC01谱系转录物,其中包含组织成不同系统发育进化枝的多种抗体。流行的进化枝保持了抗原识别的特征,尽管每个进化的结合环和二硫键形成了独特的识别表面。在研究期间,VRC01血统进化枝不断进化,每年每100个核苷酸〜2个置换的速率与HIV-1进化相当。如此高的抗体进化速度提供了一种机制,抗体谱系可通过该机制实现非凡的多样性,并在多年的慢性感染中发展出有效的HIV-1中和作用。

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