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An inverse problem formulation for parameter estimation of a reaction-diffusion model of low grade gliomas

机译:低度胶质瘤反应扩散模型参数估计的逆问题公式

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摘要

We present a numerical scheme for solving a parameter estimation problem for a model of low-grade glioma growth. Our goal is to estimate the spatial distribution of tumor concentration, as well as the magnitude of anisotropic tumor diffusion. We use a constrained optimization formulation with a reaction-diffusion model that results in a system of nonlinear partial differential equations (PDEs). In our formulation, we estimate the parameters using partially observed, noisy tumor concentration data at two different time instances, along with white matter fiber directions derived from diffusion tensor imaging (DTI). The optimization problem is solved with a Gauss-Newton reduced space algorithm. We present the formulation and outline the numerical algorithms for solving the resulting equations. We test the method using synthetic dataset and compute the reconstruction error for different noise levels and detection thresholds for monofocal and multifocal test cases.
机译:我们提出了一种数值方案,用于解决低级神经胶质瘤生长模型的参数估计问题。我们的目标是估计肿瘤浓度的空间分布以及各向异性肿瘤扩散的幅度。我们使用带有反应扩散模型的约束优化公式,该模型导致系统生成非线性偏微分方程(PDE)。在我们的配方中,我们使用在两个不同时间实例上部分观察到的嘈杂肿瘤浓度数据以及从扩散张量成像(DTI)得出的白质纤维方向来估计参数。用高斯-牛顿缩减空间算法解决了优化问题。我们介绍该公式并概述用于求解所得方程的数值算法。我们使用合成数据集测试该方法,并针对单焦点和多焦点测试案例计算不同噪声水平和检测阈值的重构误差。

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