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Unveiled electric profiles within hydrogen bonds suggest DNA base pairs with similar bond strengths

机译:氢键中未显示的电学特征表明具有相似键强度的DNA碱基对

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摘要

Electrical forces are the background of all the interactions occurring in biochemical systems. From here and by using a combination of ab-initio and ad-hoc models, we introduce the first description of electric field profiles with intrabond resolution to support a characterization of single bond forces attending to its electrical origin. This fundamental issue has eluded a physical description so far. Our method is applied to describe hydrogen bonds (HB) in DNA base pairs. Numerical results reveal that base pairs in DNA could be equivalent considering HB strength contributions, which challenges previous interpretations of thermodynamic properties of DNA based on the assumption that Adenine/Thymine pairs are weaker than Guanine/Cytosine pairs due to the sole difference in the number of HB. Thus, our methodology provides solid foundations to support the development of extended models intended to go deeper into the molecular mechanisms of DNA functioning.
机译:电力是生化系统中所有相互作用的背景。从这里开始,并通过使用从头算和自组织模型的组合,我们引入了具有键内分辨率的电场分布的第一个描述,以支持表征伴随其电起源的单键力。到目前为止,这个基本问题还没有实际描述。我们的方法用于描述DNA碱基对中的氢键(HB)。数值结果表明,考虑到HB强度的贡献,DNA中的碱基对可能是等效的,这基于先前的假设,即腺嘌呤/胸腺嘧啶对弱于鸟嘌呤/胞嘧啶对,这是因为DNA的数量存在唯一差异,这对DNA的热力学性质提出了挑战。乙肝因此,我们的方法学为扩展模型的开发提供了坚实的基础,这些模型旨在更深入地研究DNA功能的分子机制。

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