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Interlocked DNA nanostructures controlled by a reversible logic circuit

机译:可逆逻辑电路控制的连锁DNA纳米结构

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摘要

DNA nanostructures constitute attractive devices for logic computing and nanomechanics. An emerging interest is to integrate these two fields and devise intelligent DNA nanorobots. Here we report a reversible logic circuit built on the programmable assembly of a double-stranded (ds) DNA [3]pseudocatenane that serves as a rigid scaffold to position two separate branched-out head-motifs, a bimolecular i-motif and a G-quadruplex. The G-quadruplex only forms when preceded by the assembly of the i-motif. The formation of the latter, in turn, requires acidic pH and unhindered mobility of the head-motif containing dsDNA nanorings with respect to the central ring to which they are interlocked, triggered by release oligodeoxynucleotides. We employ these features to convert the structural changes into Boolean operations with fluorescence labelling. The nanostructure behaves as a reversible logic circuit consisting of tandem YES and AND gates. Such reversible logic circuits integrated into functional nanodevices may guide future intelligent DNA nanorobots to manipulate cascade reactions in biological systems.
机译:DNA纳米结构构成用于逻辑计算和纳米力学的有吸引力的设备。新兴的兴趣是整合这两个领域并设计出智能的DNA纳米机器人。在这里,我们报告了一种基于双链(ds)DNA [3]假丁烷的可编程组装的可逆逻辑电路,该电路用作固定两个分开的分支头基序,双分子i-基序和G的刚性支架。 -四重体。 G-四链体仅在i-基序的装配之前形成。后者的形成反过来要求酸性pH值和含有dsDNA的dsDNA纳米环相对于其互锁的中心环的不受阻碍的迁移性,这是由释放寡聚脱氧核苷酸触发的。我们利用这些功能将结构变化转换为带有荧光标记的布尔运算。纳米结构表现为由串联YES和AND门组成的可逆逻辑电路。集成到功能纳米设备中的这种可逆逻辑电路可以指导未来的智能DNA纳米机器人操纵生物系统中的级联反应。

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