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Note: On the universality of proximal radial distribution functions of proteins

机译:注意:关于蛋白质近端径向分布函数的普遍性

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摘要

Protein hydration is important to protein structure and function. Molecular distribution functions have been an invaluable tool to study protein hydration. Proximal radial distribution functions (pRDFs) have been postulated as being transferable across proteins based on evidence collected from two proteins []. Here we selected nine proteins with different sizes as well as different secondary topologies. We show that pRDFs are universal for proteins with compact structures. We further compare these pRDFs with those calculated from polyglycines that have no defined structures to consider the extent of the validity of this approach.
机译:蛋白质水合对蛋白质结构和功能很重要。分子分布功能已经成为研究蛋白质水合作用的宝贵工具。基于从两种蛋白质中收集到的证据,已假定近端径向分布函数(pRDFs)可跨蛋白质转移。在这里,我们选择了九种具有不同大小和不同二级拓扑的蛋白质。我们表明pRDFs具有紧凑结构的蛋白质是通用的。我们进一步将这些pRDF与由没有定义结构的聚甘氨酸计算得到的pRDF进行比较,以考虑该方法有效性的程度。

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