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MetDraw: automated visualization of genome-scale metabolic network reconstructions and high-throughput data

机译:MetDraw:自动可视化基因组规模的代谢网络重建和高通量数据

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摘要

>Motivation: Metabolic reaction maps allow visualization of genome-scale models and high-throughput data in a format familiar to many biologists. However, creating a map of a large metabolic model is a difficult and time-consuming process. MetDraw fully automates the map-drawing process for metabolic models containing hundreds to thousands of reactions. MetDraw can also overlay high-throughput ‘omics’ data directly on the generated maps.>Availability and implementation: Web interface and source code are freely available at .>Contact: >Supplementary information: are available at Bioinformatics online.
机译:>动机:代谢反应图允许以许多生物学家熟悉的格式可视化基因组规模的模型和高通量数据。但是,创建大型代谢模型的图谱是困难且耗时的过程。对于包含数百至数千个反应的代谢模型,MetDraw完全自动化了地图绘制过程。 MetDraw还可以将高通量“组学”数据直接叠加在生成的地图上。>可用性和实现: Web界面和源代码可从以下位置免费获得。>联系方式: >补充信息:可从在线生物信息学获得。

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