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Improved genomic island predictions with IslandPath-DIMOB

机译:使用IslandPath-DIMOB改进的基因组岛预测

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摘要

MotivationGenomic islands (GIs) are clusters of genes of probable horizontal origin that play a major role in bacterial and archaeal genome evolution and microbial adaptability. They are of high medical and industrial interest, due to their enrichment in virulence factors, some antimicrobial resistance genes and adaptive metabolic pathways. The development of more sensitive but precise prediction tools, using either sequence composition-based methods or comparative genomics, is needed as large-scale analyses of microbial genomes increase.
机译:动机基因组岛(GIs)是可能水平起源的基因簇,在细菌和古细菌基因组进化和微生物适应性中起主要作用。由于它们在毒力因子,某些抗菌素耐药基因和适应性代谢途径方面的丰富,它们具有很高的医学和工业价值。随着微生物基因组大规模分析的增加,需要使用基于序列组成的方法或比较基因组学开发更灵敏但精确的预测工具。

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