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High-throughput intensity diffraction tomography with a computational microscope

机译:使用计算机显微镜的高通量强度衍射层析成像

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摘要

We demonstrate a motion-free intensity diffraction tomography technique that enables the direct inversion of 3D phase and absorption from intensity-only measurements for weakly scattering samples. We derive a novel linear forward model featuring slice-wise phase and absorption transfer functions using angled illumination. This new framework facilitates flexible and efficient data acquisition, enabling arbitrary sampling of the illumination angles. The reconstruction algorithm performs 3D synthetic aperture using a robust computation and memory efficient slice-wise deconvolution to achieve resolution up to the incoherent limit. We demonstrate our technique with thick biological samples having both sparse 3D structures and dense cell clusters. We further investigate the limitation of our technique when imaging strongly scattering samples. Imaging performance and the influence of multiple scattering is evaluated using a 3D sample consisting of stacked phase and absorption resolution targets. This computational microscopy system is directly built on a standard commercial microscope with a simple LED array source add-on, and promises broad applications by leveraging the ubiquitous microscopy platforms with minimal hardware modifications.
机译:我们展示了一种无运动的强度衍射层析成像技术,该技术可实现3D相位的直接反转和弱散射样品的仅强度测量的吸收。我们推导了一个新颖的线性正向模型,该模型具有使用角度照明的逐段相位和吸收传递函数。这个新框架有助于灵活高效地获取数据,从而可以对照明角度进行任意采样。重建算法使用强大的计算能力和高效的内存条带解卷积功能执行3D合成孔径,以实现高达非相干极限的分辨率。我们用具有稀疏3D结构和密集细胞簇的厚生物样品展示了我们的技术。当对强散射样品成像时,我们进一步研究了我们技术的局限性。使用由堆叠相和吸收分辨率目标组成的3D样品评估成像性能和多重散射的影响。该计算显微镜系统直接建立在带有简单LED阵列源附加件的标准商用显微镜上,并通过利用无所不在的硬件修改而无处不在的显微镜平台,有望得到广泛的应用。

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