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Design of microarray probes for virus identification and detection of emerging viruses at the genus level

机译:用于在属水平上鉴定和检测新兴病毒的微阵列探针的设计

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摘要

BackgroundMost virus detection methods are geared towards the detection of specific single viruses or just a few known targets, and lack the capability to uncover the novel viruses that cause emerging viral infections. To address this issue, we developed a computational method that identifies the conserved viral sequences at the genus level for all viral genomes available in GenBank, and established a virus probe library. The virus probes are used not only to identify known viruses but also for discerning the genera of emerging or uncharacterized ones.
机译:背景技术大多数病毒检测方法仅适用于检测特定的单个病毒或仅几个已知目标,并且缺乏发现导致新兴病毒感染的新型病毒的能力。为解决此问题,我们开发了一种计算方法,该方法可为GenBank中所有病毒基因组在属水平上识别保守的病毒序列,并建立了病毒探针库。病毒探针不仅用于识别已知病毒,而且还可用于识别新出现或未表征的病毒的属。

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