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Using GeneReg to construct time delay gene regulatory networks

机译:使用GeneReg构建延时基因调控网络

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摘要

BackgroundUnderstanding gene expression and regulation is essential for understanding biological mechanisms. Because gene expression profiling has been widely used in basic biological research, especially in transcription regulation studies, we have developed GeneReg, an easy-to-use R package, to construct gene regulatory networks from time course gene expression profiling data; More importantly, this package can provide information about time delays between expression change in a regulator and that of its target genes.
机译:背景技术了解基因表达和调控对于理解生物学机制至关重要。由于基因表达谱已广泛用于基础生物学研究中,尤其是在转录调控研究中,因此,我们开发了易于使用的R包GeneReg,以利用时程基因表达谱数据构建基因调控网络。更重要的是,该软件包可以提供有关调节子中的表达变化与其靶基因的表达变化之间的时间延迟的信息。

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