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Symbolic flux analysis for genome-scale metabolic networks

机译:基因组规模代谢网络的符号通量分析

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摘要

BackgroundWith the advent of genomic technology, the size of metabolic networks that are subject to analysis is growing. A common task when analyzing metabolic networks is to find all possible steady state regimes. There are several technical issues that have to be addressed when analyzing large metabolic networks including accumulation of numerical errors and presentation of the solution to the researcher. One way to resolve those technical issues is to analyze the network using symbolic methods. The aim of this paper is to develop a routine that symbolically finds the steady state solutions of large metabolic networks.
机译:背景技术随着基因组技术的出现,需要分析的代谢网络的规模正在不断扩大。分析代谢网络时的一项常见任务是找到所有可能的稳态方案。分析大型代谢网络时,必须解决几个技术问题,包括数值误差的累积和向研究人员介绍解决方案。解决这些技术问题的一种方法是使用符号方法分析网络。本文的目的是开发一种象征性地找到大型代谢网络的稳态解的例程。

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