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The IMB Jena Image Library of Biological Macromolecules: 2002 update

机译:IMB Jena生物大分子图像库:2002年更新

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摘要

The IMB Jena Image Library of Biological Macromolecules (http://www.imb-jena.de/IMAGE.html) is aimed at a better dissemination of information on three-dimensional biopolymer structures with an emphasis on visualization and analysis. It provides access to all structure entries deposited at the Protein Data Bank (PDB) and Nucleic Acid Database (NDB). In addition, basic information on the architecture of biological macromolecules is offered. Recent developments include a site database and an analysis tool that identifies all residues surrounding hetero components or sites according to geometrical criteria. This enables one to search for all structures with a certain pattern of amino acids/nucleotides/water adjacent to hetero components or sites. A new PDB/SWISS-PROT cross-reference database combines information from both PDB and SWISS-PROT, thus providing significantly more cross-references than either PDB or SWISS-PROT. The existing brief descriptions of X-ray, NMR and FTIR methods for structure determination are supplemented by information on circular dichroism.
机译:IMB Jena生物大分子图像库(http://www.imb-jena.de/IMAGE.html)旨在更好地传播三维生物聚合物结构的信息,重点是可视化和分析。它提供对存放在蛋白质数据库(PDB)和核酸数据库(NDB)中的所有结构条目的访问。此外,还提供了有关生物大分子结构的基本信息。最近的发展包括站点数据库和分析工具,该工具可根据几何标准识别异质成分或站点周围的所有残基。这使人们能够搜索与异质成分或位点相邻的具有某种氨基酸/核苷酸/水模式的所有结构。新的PDB / SWISS-PROT交叉引用数据库结合了PDB和SWISS-PROT的信息,因此与PDB或SWISS-PROT相比,提供了更多的交叉引用。现有的用于结构确定的X射线,NMR和FTIR方法的简要说明通过圆二色性信息得到补充。

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