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A Highlights from MBoC Selection: Model-guided optogenetic study of PKA signaling in budding yeast

机译:MBoC选择的亮点:发芽酵母中PKA信号传导的模型指导的光遗传学研究

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摘要

In eukaryotes, protein kinase A (PKA) is a master regulator of cell proliferation and survival. The activity of PKA is subject to elaborate control and exhibits complex time dynamics. To probe the quantitative attributes of PKA dynamics in the yeast Saccharomyces cerevisiae, we developed an optogenetic strategy that uses a photoactivatable adenylate cyclase to achieve real-time regulation of cAMP and the PKA pathway. We capitalize on the precise and rapid control afforded by this optogenetic tool, together with quantitative computational modeling, to study the properties of feedback in the PKA signaling network and dissect the nonintuitive dynamic effects that ensue from perturbing its components. Our analyses reveal that negative feedback channeled through the Ras1/2 GTPase is delayed, pinpointing its time scale and its contribution to the dynamic features of the cAMP/PKA signaling network.
机译:在真核生物中,蛋白激酶A(PKA)是细胞增殖和存活的主要调节剂。 PKA的活动受到精心控制,并表现出复杂的时间动态。为了探查啤酒酵母中PKA动态的定量属性,我们开发了一种光遗传学策略,该策略使用可光活化的腺苷酸环化酶来实现cAMP和PKA途径的实时调控。我们利用这种光遗传学工具提供的精确和快速控制,以及定量计算模型,来研究PKA信号网络中的反馈特性,并剖析因干扰其组件而产生的非直观动态效果。我们的分析表明,通过Ras1 / 2 GTPase传递的负反馈被延迟,从而确定了其时间尺度及其对cAMP / PKA信号网络动态特性的贡献。

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