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Crystallization and preliminary X-ray analysis of a hyperthermophilic endoglucanase from Pyrococcus furiosus

机译:激烈热球菌嗜热内切葡聚糖酶的结晶和初步X射线分析

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摘要

The hyperthermophilic glycoside hydrolase family 12 endocellulase from the archaeon Pyrococcus furiosus (EGPf) catalyzes the hydrolytic cleavage of the β-­1,4-glucosidic linkage in β-glucans in biomass. EGPf (Gene ID PF0854; EC 3.2.1.4) contains a signal sequence and proline- and hydroxyl-rich regions at the N-terminus. Truncated EGPf (EGPfΔN30) without the proline- and hydroxyl-rich regions at the N-terminus was prepared and subjected to crystallization experiments. Crystals were obtained using the hanging-drop vapour-diffusion method at 303 K. An X-ray diffraction data set was collected to 1.07 Å resolution at 100 K. The crystal belonged to space group P21212, with unit-cell parameters a = 58.01, b = 118.67, c = 46.76 Å. The presence of one molecule of enzyme per asymmetric unit gives a crystal volume per protein mass (V M) of 2.63 Å3 Da−1 and a solvent content of 53.3%(v/v).
机译:来自古生热球菌(EGPf)的超嗜热糖苷水解酶家族12内切纤维素酶催化生物质中β-葡聚糖中β-­1,4-糖苷键的水解裂解。 EGPf(基因ID PF0854; EC 3.2.1.4)在N端包含一个信号序列以及脯氨酸和羟基丰富的区域。制备了在N端没有脯氨酸和羟基富集区域的截短的EGPf(EGPfΔN30),并进行了结晶实验。使用悬滴蒸汽扩散法在303 K下获得晶体。在100 K下收集到的X射线衍射数据集的分辨率为1.07Å。该晶体属于空间群P21212,其晶胞参数a = 58.01, b = 118.67,c = 46.76。每个不对称单位存在一分子酶,其每蛋白质质量(VM)的晶体体积为2.63Åsup> 3 Da -1 ,溶剂含量为53.3%(v / v)。

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