仔猪肠道微生物宏基因组的研究分析

摘要

试验采用高通量测序技术分析仔猪在不同生长阶段肠道微生物菌群的动态变化。从同窝仔猪中随机选择健康仔猪3头，于出生当天（0 d）、出生后5 d、7 d、15 d、23 d（21日龄断奶，即断奶后2 d）和60 d收集仔猪粪便样品进行16SDNA V3-V4段测序，对照数据库进行聚类分析和物种分类学分析，以纲分类进行仔猪粪便微生物宏基因分析。结果表明，仔猪出生当天（0 d）的优势菌主要为γ-变形菌、杆菌、β变形菌、梭状芽胞杆菌、黄杆菌、拟杆菌；出生后5d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、杆菌、γ-变形菌；出生后7d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、杆菌、拟杆菌、γ-变形菌、黄杆菌、β变形菌、ε变形菌；出生后15 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、杆菌、γ-变形菌、拟杆菌；出生后23 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、革兰氏阴性厚壁菌；出生后60 d的优势菌主要为梭状芽胞杆菌、拟杆菌、杆菌、革兰氏阴性厚壁菌。研究表明，仔猪在刚出生阶段肠道微生物菌群与其他阶段显著不同，且21日龄断奶对菌群分布影响较大。