湖北麻鸭乙型肝炎病毒全基因组的克隆和序列分析

摘要

为了解湖北地区 This finding was also confirmed by the phylogenetic tree analysis.麻鸭中鸭乙型肝炎病毒（Duck hepatitis B virus, DHBV）自然感染状况以及湖北麻鸭所携带DHBV的基因结构特征，采集了70份成年麻鸭血清并应用PCR技术检测DHBV DNA，对其中一份DHBV DNA阳性血清进行DHBV全基因扩增，并进行克隆与序列测定分析。结果表明，湖北麻鸭DHBV自然携带率为10％；湖北DHBV分离株（GenBank登录号DQ276978）基因组的全长为3024bp，有编码P，S和C蛋白的三个开放阅读框：与GenBank中17株DHBV基因组比较，核苷酸同源性介于89．85％～93．29％之间；S蛋白、C蛋白和P蛋白结构功能区序列均高度保守；而对P蛋白标志性氨基酸和全基因进化树的分析表明，该分离株属于DHBV中国基因型中的一个亚型。