樱桃谷鸭乙型肝炎病毒河南分离株全基因组克隆与序列分析

摘要

目的：通过调查河南省樱桃谷鸭主产区DHBV自然感染情况和分析河南省樱桃谷鸭DHBV基因序列特点，为樱桃谷鸭DHBV感染模型的建立提供依据。方法：在河南省信阳、新郑、焦作三个樱桃谷鸭主产区鸭场采取鸭血，分离血清，提取病毒基因组。根据GenBank收录的DHBV基因组序列设计引物，三地各挑选一株扩增全基因组，克隆到pMD18-T载体中，并对克隆产物进行测序。结果：信阳市樱桃谷鸭感染率为10.5% (13/156)，新郑市为8.9% (27/330);焦作市为42.9% ( 3/7 )。进化树分析显示，DHBV-XY为西方基因型的一个亚型，而DHBV-XZ, DHBV-JZ为中国基因型。结论：同源性及进化树分析表明，河南省樱桃谷鸭DHBV区域性差异很大且复杂。对于河南樱桃谷鸭DHBV的研究可能会有助于嗜肝DNA病毒起源的研究。