姜曲海猪mtDNA D-loop序列遗传多样性研究

摘要

为研究姜曲海猪保种群线粒体DNA遗传多样性及种质特性,选取姜曲海猪保种群中58个体进行mtDNA D-loop高变区序列扩增测序,获得的长度为427 bp有效序列基因片段,然后对有效序列遗传多样性进行了分析。结果表明:(1)姜曲海猪的mtDNA D-loop高变区扩增测序的有效序列基因片段中,碱基A+T含量为63.2%,G+C含量为36.8%,碱基A+T含量明显高于G+C含量;(2)在58个序列中共有15个变异位点,其中T/C转换10次、G/A转换3次、A/T颠换1次、C/A颠换1次;(3)检测出单倍型3个,总的单倍型多样性和核苷酸多样性指数分别为0.686和0.0052,表明姜曲海猪种群遗传多样性偏低,姜曲海猪保种群母系来源单一;(4)单倍型间遗传距离计算结果表明,种群内3个单倍型之间的平均遗传距离在0.003~0.005之间,单倍体间的遗传距离较近,表明保种群近交的情况比较严重。