西林水牛和富钟水牛mtDNA D-loop序列的遗传多样性研究

摘要

该研究旨在探究西林水牛和富钟水牛mtDNA的遗传多样性和母系起源.采用PCR扩增、测序及生物信息学方法,测定了 60头西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列.结合GenBank数据库已公布的25条西林水牛和富钟水牛的mtDNA D-loop序列联合进行多态性分析,共检测到60个多态位点,定义了 38种mtDNA单倍型.西林水牛和富钟水牛的单倍型多样度分别为0.909±0.028和0.913±0.035,核苷酸多样度分别为0.019±0.004和0.013±0.005,这一结果表明西林水牛和富钟水牛具有丰富的遗传多样性.NJ系统发育树显示,西林水牛和富钟水牛均属于沼泽型水牛,且有A支系和B支系两个母系起源.