西藏牦牛mtDNA ND5遗传多样性及系统进化分析

摘要

为了解西藏牦牛的遗传多样性和群体分化情况,本研究测定了西藏15个牦牛类群的mtDNA ND5基因序列,分析其遗传多样性、亲缘关系及分类.结果表明:①西藏牦牛mtDNA ND5全序列长度在1821～1823bp,无内含子,T、C、A和G4种碱基的平均比例分别为32.9％、10.6％、27.5％、29.0％,存在一定的碱基组成偏倚性.②共发现变异位点36个,其中15个单态突变位点,13个简约信息位点;存在碱基缺失、插入、转换和颠换等,插入或缺失位点8个,T/C转换较多,G/C颠换较少.③西藏牦牛mtDNA ND共有23种单倍型,平均单倍型数(H)、平均单倍型多样性(Hd)、平均核苷酸多样性(R)分别为3.4667、0.5100和0.00102,表明西藏牦牛具有丰富的遗传多样性.④西藏牦牛mtDNA ND5基因共含20种氨基酸,其中缬氨酸最多,占10.37％,组氨酸最少,仅为1.11％.⑤在西藏牦牛的聚类分析中,仲巴牦牛、桑桑牦牛、斯布牦牛、错那牦牛、日多牦牛、嘉里牦牛、工布江达牦牛、康布牦牛、江达牦牛、桑日牦牛、丁青牦牛、聂荣牦牛、帕里牦牛首先聚为一大类,再依次与隆子牦牛和类乌齐牦牛相聚.