前列腺癌组织中具有潜在生物标记物特性的miRNA及其靶基因生物学功能、信号通路分析

摘要

目的 筛选前列腺癌组织中具有潜在生物标记物特征的微小RNA(miRNA),并分析其靶基因的生物学功能及信号通路.方法 采用癌症和肿瘤基因图谱计划(TCGA)数据库下载前列腺癌相关数据集,分析前列腺癌组织与癌旁组织miRNA的表达情况,筛选差异表达miRNA,采用Kaplan-Meier生存曲线分析前列腺癌患者的生存情况,筛选出具有潜在生物标记物特性(高表达、预后差)的miRNA.采用生物信息学在线网站预测有潜在生物标记物特性miRNA的靶基因,进行基因本体(GO)富集分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,分析有潜在生物标记物特性miRNA的靶基因主要参与的生物学功能及肿瘤相关通路.结果 前列腺癌组织、癌旁组织共159个差异表达miRNA,其中表达下调59个、表达上调100个.生存分析结果显示,miR-17高表达的胰腺癌患者预后差.前列腺癌组织、癌旁组织miR-17的相对表达量分别为3852.66±1800.41、1581.22±391.71,二者比较,P<0.001.miR-17共138个靶基因,主要参与转录DNA模版化、蛋白质磷酸化、甲基胞嘧啶分解代谢、正调控凋亡过程、钠离子跨膜转运、胞质分裂等生物学过程;主要分子功能包括它们与蛋白激酶结合、核酸结合、金属离子结合、钙离子结合、蛋白质结合等.与miR-17靶基因有关的信号通路有雌激素信号通路、cAMP信号传导途径、趋化因子信号通路、HIF-1信号通路和癌症蛋白聚糖信号通路等13条信号通路.结论 miR-17可作为前列腺癌发生和预后评价的潜在生物标记物.