基于线粒体D-loop序列的泰山赤鳞鱼多态性分析

摘要

通过对24条泰山赤鳞鱼DNA提取、PCR技术对线粒体D-loop序列进行扩增.PCR产物经纯化并进行序列测定后,得到的核苷酸片段约900 bp.运用MEGA5.10软件计算其成对序列遗传距离,并根据D-loop序列建立了邻接法(Neighbor-Joining,NJ)系统树.通过DNASP软件计算出这24个个体的遗传多样性参数其多态性参数为:多态位点数(S)为71,单倍型个数(H)为19,单倍型多样性(h)为0.96,核苷酸多样性(π)为0.01112,平均核苷酸差异数(k)为8.739.研究发现泰山赤鳞鱼具有较高的单倍型多样性,但其核苷酸多样性较低.所构建NJ系统树拓扑结构基本一致,24个个体均形成两大分支,由于线粒体DNA属于母系遗传,由此可推断该群体的24个个体可能来源于两个不同的母系祖先.