山羊捻转血矛线虫ITS基因序列分析

摘要

为了解不同年份山羊源捻转血矛线虫内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)基因的遗传变异情况,提取2015年-2020年间陕西省咸阳地区44株山羊源捻转血矛线虫的核糖体DNA(rDNA),对其ITS基因进行扩增、测序与分析。结果显示,44株捻转血矛线虫的ITS-1序列长度为400 bp~404 bp,种内变异率为0~4.1%,与GenBank中英国捻转血矛线虫ITS-1参考序列LS997563的相似性为97.01%~99.75%;ITS-2序列长度为231 bp,种内变异率为0~6.3%,与GenBank中尼日利亚捻转血矛线虫ITS-2参考序列LC368048的相似性为96.97%~100%。结果表明,2015年-2020年间咸阳地区山羊源捻转血矛线虫ITS-1、ITS-2基因均有不同程度的遗传变异,但未出现新的种群分化。此外,基于虫体代表性样本ITS-1、ITS-2序列构建的遗传进化树结果显示,不同国家和地区的分离株进化关系均较为接近,在ITS-1进化树中,只有捻转血矛线虫样本SX17-3与GenBank中陕西ITS-1序列(KX534100)汇于同一支上,在ITS-2进化树中,也只有SX15-8、SX17-9、SX17-113株捻转血矛线虫样本分离株与陕西ITS-1序列(KX534100)距离最近,表明捻转血矛线虫ITS基因序列的变异情况与地理条件之间无明显相关性。