猪圆环病毒2型吉林分离株全基因组的克隆与序列分析

摘要

从吉林某猪场采集疑似患断奶仔猪多系统衰竭综合征死亡的猪体病料,进行猪圆环病毒2型(PCV-2)的分离；分离培养物经荧光标记的PCV-2特异抗体染色鉴定,并用PCV-2全基因组的特异性引物扩增,进行序列测定和分析.结果表明,从采集病料中成功分离出一株猪圆环病毒2型,并将此吉林分离株命名为PCV-2-JL11S,对其进行全基因测序,拼接结果显示,基因组全长为1 767 bp;将分离株病毒的全基因组序列与14株GenBank已登录病毒进行比较,结果显示,核苷酸同源性最高可达99.2％;全基因序列系统进化树结果表明,分离株与HQ395057关系最近,而与HQ395037关系较远.上述结果表明,PCV-2吉林分离株存在一定的基因变异,而变异的发生原因尚需深入研究.