基于16S rRNA基因测序比较分析不同抗生素干预对小鼠肠道菌群动态变化的影响

摘要

目的探讨不同种类抗生素对小鼠肠道菌群多样性和组成动态变化的影响。方法采用健康SPF级雌性C57BL/6小鼠20只随机分为对照组（CON组）6只、万古霉素组（VAN组）6只和多黏菌素组（PMB组）8只,通过饮用抗生素方式连续处理5周,于3周、5周采集小鼠粪便样本进行16S rRNA基因的V4-V5区测序。结果与CON组相比,VAN组处理3周和5周菌群多样性显著降低,以疣微菌门（阿克曼菌科）、变形菌门（肠杆菌科）及无胆支原体科相对丰度显著增加,拟杆菌门（Muribaculaceae菌科、普雷沃菌科）和毛螺菌科显著减少为特征（P均＜0.05）。PMB组处理3周后,菌群多样性显著增加,以普雷沃菌科和毛螺菌科相对丰度显著增加,疣微菌门（阿克曼菌科）和Muribaculaceae菌科显著减少为特征。PMB处理5周后,菌群多样性显著降低,以疣微菌门（阿克曼菌科）相对丰度显著增加,而厚壁菌门（毛螺菌科）显著减少为特征（P均＜0.05）。结论用不同种类的抗生素处理不同时间后小鼠肠道菌群组成不同,但多样性均显著降低,且抗生素处理时间越长菌群多样性降低幅度越大,菌群种类越少。