基于16S rRNA测序分析脂多糖结合蛋白基因敲除对小鼠肠道菌群的影响

摘要

目的探究脂多糖结合蛋白基因(Lbp)敲除对小鼠肠道菌群结构的影响。方法随机选取8只Lbp^(-/-)小鼠作为Lbp^(-/-)组,8只WT小鼠作为WT组。处死小鼠,解剖后取盲肠并编号,进行16S rRNA测序,采用OTU聚类分析、Alpha多样性分析、Beta多样性分析、门水平和属水平差异分析等方法分别对两组小鼠肠道菌群的丰度、多样性和物种组成进行研究。结果与WT组相比,Lbp^(-/-)组小鼠在门水平上,拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著升高,柔膜菌门(Tenericutes)、厚壁菌门(Firmicutes)等相对丰度显著降低;在属水平上,拟杆菌属(Bacteroides)、普氏菌属(Prevotella)等相对丰度显著升高,IV梭菌属(Clostridium IV)、双歧杆菌属(Olsenella)等相对丰度显著降低。结论Lbp敲除后拟杆菌属和普氏菌属丰度显著升高,这两类菌与多种肠道炎症性疾病密切相关,这为临床检测炎症相关疾病发生发展提供参考。