利用网络药理学与分子对接技术分析石见穿在治疗癌症中的作用机制

摘要

目的 利用网络药理学和分子对接技术分析石见穿治疗癌症的作用机制.方法 分别基于不同数据库收集石见穿的所有活性成分,寻找活性成分的预测靶点,获得所有癌症相关基因,再通过String结合Cytoscape绘制蛋白相互作用网络,归纳总结石见穿主要潜在靶点,采用DISCOVERY STUDIO对接潜在的作用靶点(靶点数目最多的活性成分和蛋白相互作用中自由度最大的蛋白质).结果 石见穿主要的活性成分为阿魏醛、熊果酸和齐墩果酸等,预测靶点与癌症交叉共有靶点有84个,核心靶点分别为白介素-6(IL-6)、丝裂原活化蛋白激酶1和3(MAPK1、MAPK3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2),分子对接显示石见穿中阿魏醛能与IL-6稳定结合,并分别通过氨基酸残基SER L52、ARG H99、ARG H33、ALA H100、GLY L36、ASP L93、ASP H106;齐墩果酸能与MAPK3、EGFR稳定结合,分别通过GLU B50、ALA A289、SERA291、THR A339、VAL A312、CYS A309、CYS A305、ARG A310等氨基酸残基连接.熊果酸分别通过GLY B49、VAL B56、TYRB53、LEUB124、ILEB48、CYSB183、METB125、LEUB173等氨基酸残基与MAPK3、EGFR稳定结合.结论 该研究揭示了石见穿治疗癌症是基于多成分、多靶点、多通路的协作相互作用的潜在机制,为后续的分子机制研究提供方向与思路.