应用SuperTRI方法重建百合目的系统发育关系

摘要

SuperTRI是Ropiquet等（2009）发表的一种新的超树方法,可以通过合并所有系统发育信息来共同组建大的系统发育树。该方法克服了超矩阵法和传统超树法的一些限制,使提出的系统发育假说可信度更高,更具有统计说服力。本文应用SupperTRI方法重建了百合目（Liliales）主要类群的系统发育关系,并与超矩阵法的分析结果进行了比较。结果显示：（1）SuperTRI方法产生了与超矩阵法相似的拓扑结构,但节点支持率相对较低,其中再现性指数对评判分支的可信性更容易理解,在系统树图示方法上也更直观;（2）SuperTRI系统树证实百合科、菝葜科、垂花科和菝葜藤科为一单系分支;黑药花科为一独立分支;秋水仙科、六出花科、刺藤科为一单系分支,但这3个大分支间的关系未明;支持白玉簪科和金梅草科互为姐妹群,是百合目最基部类群。