仿刺参(Apostichopus japonicus)mtDNA三个基因片段的序列分析

摘要

采用PCR技术对中国烟台、威海和莱州三个地点仿刺参的16S rRNA、COI、IrRNA-COI三个mtDNA基因片段进行了扩增和测序,分别得到了长度约为570bp、640bp和900bp的三段序列,分析了三个采样点样品的遗传多样性.结果表明,每段基因序列扩增均获得两种单倍型,已在Genbank中注册(注册号码:AY852278-AY852283).通过比较,三个地点样品的序列差异不显著,无缺失、插入、颠换的现象,只有个别位点出现转换,其中16S rRNA序列最为保守,16S rRNA、COI、IrRNA-COI三段序列A+T的平均含量为56.2%、59.2%、61.8%,均大于G+C含量.三个采样点样品同源性为99.84%-99.96%.将获得的仿刺参DNA序列和Genbank中的来自东太平洋8个外群进行基因序列比较,结果发现,不同目、科的海参的序列差异显著.采用DNAsp统计了各类位点数;MEGA2.1分析了碱基组成和遗传距离,构建了系统树.系统树体现的分类关系与这些物种的形态学分类关系完全一致.