长牡蛎(Crassostrea gigas)17个EST-SNP标记的开发

摘要

利用长牡蛎已有的EST序列数据库,筛选得到候选SNP位点共计1140个.根据候选SNP位点共设计引物82组,通过片段长度差异等位基因特异性PCR(fragment length discrepant allele specific PCR,FLDAS-PCR)的分型方法,在一野生群体中进行检测和验证,结果共有17个SNP候选位点显示多态性.研究结果表明,通过基于EST数据库的SNP开发,可以有效弥补某些海洋生物因基因组学滞后影响SNP标记开发的现状.