沙柳SpsLAS2和SpsLAS3基因克隆与生物信息学及组织特异性表达分析

摘要

为促进沙柳(Salix psammophila)的分子定向育种,研究其分枝调控遗传机制,以沙柳为试验材料,采用同源克隆技术克隆获得沙柳SpsLAS2、SpsLAS3基因并做生物信息学及组织特异性表达分析.结果 表明:SpsLAS2和SpsLAS3基因序列相似性达96.7％,氨基酸序列相似性达97.6％.SpsLAS2和SpsLAS3基因ORF长分别为1 248、1254 bp,分别编码415 aa和417 aa.其氨基酸序列具有GRAS(Gibberellin-Insensitive,Repressor of ga1-3,Scarecrow)基因家族典型的5个结构域[1],属LS亚家族.qRT-PCR组织特异性分析发现2个基因均在叶腋处表达量最高,表明2个基因在叶腋中是特异表达的,可能调节叶腋分生组织的发育形成.SpsLAS2、SpsLAS3相似度较高,但也存在一定差异,推测2个基因可能是同一染色体的串联基因倍增关系.