石榴果皮DAHPS基因的克隆与生物信息学分析

摘要

以‘泰山红’石榴果实为试材,利用RT-PCR技术克隆石榴果皮DAHPS部分基因并对其进行了生物信息学分析.结果表明:获得1 373 bp的DAHPS基因cDNA片段编码393个氨基酸,其氨基酸序列与甜橙(XP _ 006472576.1)、白梨(XP _ 009372963.1)、葡萄(NP_001268096.1)、苹果(XP 008386115.1)的相似性分别为94％、93％、92％、92％;预测蛋白质理论分子量约为44 kDa,等电点为9.00,具有Cys-Ser-Ala-His保守区和典型的DAHP_ synthe_2超家族保守结构域,为亲水性和跨膜蛋白,不是分泌蛋白;蛋白质二级结构主要由无规则卷曲(40.97％)、α-螺旋(38.17％)、伸展链(12.47％)和β-转角(8.40％)组成.GenBank登录号为KU198932.该研究结果为揭示石榴果实中没食子酸的代谢机理奠定了理论基础.