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基于基因组数据解析大球盖菇交配型系统

         

摘要

大球盖菇Stropharia rugosoannulata是一种具有较强木质纤维素降解能力以及高营养的重要食用菌.此菌属于四极性异宗结合担子菌,但是交配型位点结构仍未被解析.本研究利用基因组数据通过生物信息学方法进行大球盖菇的A和B交配型位点解析,并与其他大型真菌进行比较.结果 显示大球盖菇的A交配型位点包含了一对保守的HD1和HD2基因,位点上下游基因的共线性较高,与Galerina patagonica和砖红韧黑伞Hypholoma sublateritium相似度最高,A位点结构上也较为保守,在上下游具有保守的MIP、Sec61蛋白、甘氨酸脱氢酶和β侧翼蛋白.B位点包含5个信息素受体和3个信息素前体基因,与其他真菌相比较发现,B位点及上下游基因的共线性较差,表明在不同的真菌中B位点变异性较大.本研究所获得的结果将有助于诠释大球盖菇交配型位点结构,为今后的遗传育种提供了理论依据.

著录项

  • 来源
    《菌物学报》 |2020年第6期|1152-1161|共10页
  • 作者单位

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    上海海洋大学食品学院 上海201306;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    上海海洋大学食品学院 上海201306;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    上海海洋大学食品学院 上海201306;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    合肥学院生物食品与环境学院 安徽合肥230601;

    国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所 上海201403;

    上海海洋大学食品学院 上海201306;

  • 原文格式 PDF
  • 正文语种 chi
  • 中图分类
  • 关键词

    大球盖菇; A交配型位点; B交配型位点; 共线性;

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