石金钱龟低聚肽制备工艺优化及其抑制新冠病毒的潜能

摘要

为了探究石金钱龟低聚肽作为新冠肺炎病毒(SARS-Co V-2)药物开发原料的可能性,该研究用“风味蛋白酶+木瓜蛋白酶”组合对龟肉进行酶解,通过不同酶配比、加酶量、pH和酶解时间的单因素实验和正交实验确定最优工艺条件,制备出石金钱龟低聚肽。再通过HPLC-MS分离、PeakStudio解析、PeptideRanker活性预测逐步筛选出活性较高的低聚肽,最后进行各低聚肽序列与SARS-COV-2棘突蛋白(S蛋白)的分子对接。结果显示,最佳工艺参数为风味蛋白酶:木瓜蛋白酶=7:3、加酶量7%、pH 5.5、酶解时间4 h,此时的水解度为42.56%;Peak Studio解析出可信度(ALC)>90%的肽共510条,经Peptide Ranker生物活性评估后筛选出6条低聚肽与S蛋白分子对接,低聚肽序列分别为:LDFFK、LDFFKAL、FRVL、AFRVL、AGGKPFQ、SPFRVT,其Docking Score在-138.50--169.68之间,其中LDFFKAL的Docking Score最低,为-169.68,说明该低聚肽抑制新冠肺炎病毒的潜能最强。总的来说,经工艺优化后石金钱龟龟肉的水解度大大增加,且制得的石金钱龟低聚肽有较强的抑制新冠肺炎病毒的潜能。