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胃癌中端粒相关基因亚型鉴定、预后模型构建以及免疫细胞浸润分析

     

摘要

目的本研究旨在基于对端粒相关基因(Telomere related genes,TRG)表达数据的综合分析,探讨预后分子特征以预测胃癌(GC)的预后及与免疫细胞浸润的关系。方法联合TCGA与GEO数据库对胃癌端粒相关基因进行生存分析及预后相关性分析。通过无监督聚类确定两个端粒相关基因簇,依据Lasso回归及多因素cox回归分析构建预后模型,结合临床性状构建列线图预测患者生存期,同时进行风险差异分析,运用ROC曲线评估模型预测准确性,对样本进行免疫细胞浸润分析。结果构建了包含HEYL、SPC25、SRPX2、PDK4、LOXL4、SOX15、SLC39A4、MAGEA3、SHISA2、DEFB1、SLC27A2和C1QTNF5等12个基因的预后模型来评估胃癌患者的预后,构建了整合风险特征的列线图来预测胃癌患者的1年、3年和5年总生存期(OS),高风险组的生存率显著低于低风险组(P<0.05),不同风险组的免疫细胞亚型比例不同。结论这项研究鉴定了胃癌中TRG衍生的分子亚型,并开发了一种新的预后评分模型,突出了TRG在胃癌预后和免疫治疗中的潜在价值。

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